גדר ההפרדה היא חומת ההפרדה או גדר הביטחון, לעניין השם ראו בהמשך) היא מחסום הפרדה הנבנֶה על ידי ישראל בעיקר לאורך הקו הירוק מאז 2002. לשם מניעת מעבר בלתי מורשה של פלסטינים מיהודה ושומרון למרכזי אוכלוסייה ישראליים, במטרה למנוע חדירת מחבלים פלסטינים, ובכללם מחבלים מתאבדים. עוטף ירושלים הוא שמו של קטע בגדר ההפרדה באזור ירושלים, מטרת תוואי הגדר באזור זה לחצוץ בין ריכוזי האוכלוסייה הישראליים והפלסטינים, על מנת לשפר את הביטחון בישראל. אורכו של עוטף ירושלים עומד על 168 ק"מ, מהר אדר בצפון ועד גוש עציון בדרום - ב -2004הוקמה מפקדה ייעודית של משמר הגבול באזור זה. ישראל בודדה את הכפר בית איכסא ממזרח ירושלים ומשאר הגדה המערבית כפר הפלסטיני בית איכסא נמצא צפון-מערב לירושלים, בתוך שטח הגדה המערבית ומחוץ לשטח המוניציפאלי של ירושלים. לאורך השנים הוקמו מסביבו ועל חלק מהאדמות שהיו בבעלות תושביו, ההתנחלות רמות אלון המהווה שכונה במזרח ירושלים, ושכונת הר שמואל בהתנחלות גבעת זאב. בנוסף,הופקעו בשנת 2010 חמישים דונם מאדמותיו לטובת קו הרכבת המהיר מירושלים לתל-אביב. על פי מפקד האוכלוסין שבוצע בגדה המערבית בשנת 2007, חיים בכפר כ-1900 בני אדם, רבים מתושבי הכפר הם תושבי ירושלים, המחזיקים בתעודות זהות ישראליות. בניגוד לכפרים פלסטיניים אחרים באזור, המוקפים בגדר המפרידה בינם לבין ישראל, צדו המזרחי של בית איכסא, הפונה לשכונת רמות, אינו מוקף בשלב בגדר ובין הכפר לשכונה – הנמצאות במרחק של כמה מאות מטרים – מפריד רק וואדי. עם זאת, הכפר מופרד משאר כפרי האזור הסמוכים לו באמצעות גדר אלקטרונית המקיפה אותו מצפון-מערב ומתחברת לגדר ההפרדה. על פי כתבה שפורסמה בשנת 2009 בעיתון 'הארץ' החליטה ממשלת ישראל בשנת 20066 כי הכפר יוותר בצד הפלסטיני של גדר ההפרדה, זאת בניגוד לתוואי הגדר המקורי לפיו נועד להיוותר בצדה 'הישראלי' של גדר ההפרדה. זאת, על-פי הכתבה, משום שבית איכסא חולש על אזור רמות וכביש 1, ובשל קיומן של אדמות שישראלים רכשו בעבר בשטחים הסמוכים לכפר. חרף זאת, מאז ההחלטה לא הוקמה גדר המפרידה בין בית איכסא לבין ישראל. במקום זאת הוקמה הגדר המקיפה את בית איכסא מכיוון צפון-מערב שהוגדרה על-ידי מערכת הביטחון כ'זמנית'. תוואי הגדר נקבע ביחס לגבולותיה המוניציפאליים של ירושלים, אך לא פחות מכך גם ביחס להתנחלויות